环境因素对药物的影响尤为明显。特别是对外用药物的影响，更为显著。
(1)水温 外用药物对水温比较敏感。通常表现为水温升高，药物作用增强，同时对观赏鱼的毒性增强。例如，各种消毒剂和杀虫剂的消毒杀虫速度和效力就随着水温的升高而加快和增强，同时对观赏鱼的毒性也随之增强。因此，当水温较高时，应适当降低药物用量。
(2)酸碱度 酸碱度对消毒剂和杀虫剂的影响，表现为可以改变药物的溶解度、离解度和分子结构。例如，硫酸铜在酸性水体中，可以保持较多的自由状态的铜离子，其杀虫效果较强。敌百虫在酸性水中较稳定，在碱性高的水中易被碱化而分解成毒性更强的敌敌畏。
(3)有机物 有机物在水中可直接影响药物的作用。一方面有机物在病原体表面形成一层保护层，直接影响消毒杀菌效果，并导致病原体逐渐对药物产生适应性；另一方面，有机物与消毒剂和杀虫剂等药物作用，形成络合物，使药物的溶解度降低，灭菌杀虫作用减弱，有时还会产生副作用。
(4)光照 强烈的光照常常伴随出现较高的水温，从而直接促进药物的化学反应增强。因此，对室外大面积养殖的观赏鱼用药时，如果有强光照，宜在下午4～5时再用药。
